▸ 病理形态学:HE染色数字化切片、特殊染色(PAS、Masson等)、免疫组化标志物(PD L1、Ki-67、HER2等)
▸ 分子病理:MSI/MMR状态、TMB评分、EBER原位杂交、FISH检测(HER2、ALK、ROS1等) ▸ 液态活检:ctDNA突变谱、CTC计数、外泌体标志物
▸ 影像学数据:基线及随访CT/MRI/PET-CT影像DICOM文件、RECIST 1.1疗效评估
▸ 生物标志物动态监测:治疗前后血清标志物变化(CEA、CA125、CA19-9等)
▸ 基因组学:全外显子测序(WES)、靶向NGS panel(50-500基因)、基因融合检测
▸ 转录组学:bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq(scRNA-seq)、空间转录组
▸ 表观遗传学:DNA甲基化谱、染色质可及性(ATAC-seq)、组蛋白修饰
▸ 蛋白质组学:质谱蛋白定量、磷酸化蛋白组、免疫组化(IHC)蛋白表达
▸ 代谢组学:非靶向代谢组、脂质组学、药物代谢酶基因型
▸ 微生物组学:肠道菌群16S rRNA测序、肿瘤微生物组检测